Perkembangan
Sejak pendirian program S2 MM FE UNCEN tahun 2002 jumlah mahasiswa yang terdaftar menunjukkan peningkatan yang sangat cepat. Pada tahun ajaran 2002/2003 jumlah mahasiswa sebanyak 64 orang, tahun ajaran 2003 sebanyak 109 orang, tahun 2004 menunjukkan peningkatan sebanyak 150 orang. Mulai tahun 2001 MM FE UNCEN Jayapura telah meluluskan sebanyak 80 orang, pada tahun 2002 sebanyak 67 orang. Data-data ini menunjukkan tingkat produktivitas Program Studi cukup baik.
Penerimaan mahasiswa pada program MM FE UNCEN dilakukan secara terbuka melalui pengumuma npada media cetak Cenderawasih Pos, dan media elektronik (RRI Nusantara V Jayapura). Persyaratan penerimaan ditetapkan berdasarkan peraturan akademik Universitas Cenderawasih. Selain seleksi berkas Program MM FE UNCEN juga menyeleksi mahasiswa melalui Tes Tertulis, Wawancara, dalam tes mana kemampuan intelektual dan kemampuan bahasa inggris diukur untuk menentukan kelulusan.
Tenaga pengajar pada Program S2 MM FE UNCEN saat afiliasi terdiri dari dosen dengan kualifikasi Profesor, Doktor (S3) dan Magister (S2), senior, dosen, yang berasal dari FE UNCEN, FE UNHAS, FE Brawijaya, dan FE UGM. Jumlah tenaga pengajar yang bergelar Profesor di FEB UNCEN saat ini 4 (empat) orang, Doktor 13 (tiga belas) orang, dan tenaga magister yang memiliki jabatan fungsional Lektor Kepala sebanyak 1 orang.
Selanjutnya sejak tahun 2002, program ini telah mendapat persetujuan Direktur Jenderal Pendidikan Tinggi dengan Surat Keputusan nomor 3708/D/T/2002 tanggal 24 Desember 2002, yang menetapkan program ini dilaksanakan secara mandiri oleh Fakultas Ekonomi Universitas Cenderawasih.
Melalui perpanjangan Ijin penyelenggaraan Program Studi Manajemen jenjang program pascasarjana (S2) tersebut, lembaga pendidikan ini terus berupaya untuk dapat menghasilkan kualitas pembelajaran yang tinggi bagi masyarakat khususnya untuk Program Pascasarjana (S2) Magister Manajemen. Program ini didukung oleh dosen-dosen yang memiliki tingkat kompetensi dan profesionalitas yang tinggi, sehingga para lulusan mampu bersaing dalam menghadapi pasar yang semakin kompetitif. Program Pascasarjana Program Studi Magister Manajemen Universitas Cenderawasih menyelenggarakan program pendidikan Manajemen untuk tingkat Strata Dua (S2) dan menghasilkan lulusan yang memiliki kemampuan professional dalam bidang Manajemen yang memperoleh apresiasi yang tinggi dan positif dari masyarakat, kajian dan inovasi dari ilmu pengetahuan Manajemen yang dapat dimanfaatkan untuk perkembangan ekonomi masyarakat, bangsa dan negara.
Dengan semakin meningkatnya laju pembangunan di segala bidang, Program Pascasarjana Program Studi Magister Manajemen Universitas Cenderawasih sebagai suatu lembaga pendidikan diharapkan akan dapat menjadi suatu lembaga yang benar-benar mantap dan tangguh sesuai dengan tuntutan jaman, baik dari segi organisasi maupun dari segi manajemennya. Dengan demikian Program Studi Magister Manajemen Universitas Cenderawasih ini mampu untuk ikut berperan serta lebih banyak dalam menunjang terlaksananya usaha pembangunan bangsa dan negara. Dengan kata lain bahwa Program Pascasarjana Program Studi Magister Manajemen Universitas Cenderawasih selain diharapkan dapat mendidik mahasiswa menjadi mahasiswa yang inovatif, juga dapat menghasilkan lulusan magister yang berkemampuan unggul di masyarakat.
Sejak didirikan sampai saat ini, Program Magister Manajemen telah berkembang dengan pesat terbukti dengan meningkatnya jumlah lulusan hingga 23 angkatan, meningkatnya IPK mahasiswa, meningkatnya jumlah dosen, bahkan untuk meningkatkan kualitas proses belajar mengajar, Program Studi Magister Manajemen telah menyelenggarakan kuliah tamu dan mengadakan kegiatan seminar dengan topik-topik menarik di bidang Manajemen.
Sejalan dengan perkembangan kehidupan Program Studi Magister Manajemen yang kian berkembang, maka guna memenuhi kebutuhan fasilitas pendidikan yang semakin meningkat, secara bertahap Program Studi juga berusaha dengan menyediakan fasilitas pendidikan yang diperlukan, seperti ruang kuliah AC, kantor Administrasi, perpustakaan, dan Akses Internet serta lain-lainnya.